{"id":240219,"date":"2025-10-20T15:09:06","date_gmt":"2025-10-20T13:09:06","guid":{"rendered":"https:\/\/www.zacam.cnrs.fr\/?p=240219"},"modified":"2025-10-29T16:00:46","modified_gmt":"2025-10-29T15:00:46","slug":"soutenance-de-la-these-doceane-rieu-circulation-et-diversite-genetique-des-coronavirus-chez-les-chauves-souris-du-sud-est-de-la-france","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.zacam.cnrs.fr\/en\/soutenance-de-la-these-doceane-rieu-circulation-et-diversite-genetique-des-coronavirus-chez-les-chauves-souris-du-sud-est-de-la-france\/","title":{"rendered":"Soutenance de la th\u00e8se d\u2019Oc\u00e9ane RIEU : Circulation et diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique des coronavirus chez les chauves-souris du Sud-Est de la France"},"content":{"rendered":"<p><\/p>\n\n\n\n<p> > \u00a0<strong>Mardi 2 d\u00e9cembre 2025 \u00e0 14h<\/strong>.<br><strong>Amphith\u00e9\u00e2tre des Plantes \u2013 IRD Montpellier<\/strong><br><a href=\"https:\/\/umontpellier-fr.zoom.us\/j\/92203205774\">Lien Zoom pour assister \u00e0 la soutenance<\/a><\/p>\n\n\n\n<p><strong>Une recherche au c\u0153ur des enjeux One Health<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>La Zone Atelier sant\u00e9-environnement Camargue a le plaisir de vous inviter \u00e0 la soutenance de th\u00e8se intitul\u00e9e <strong>\u00ab Circulation et diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique des coronavirus au sein de populations de chauves-souris du Sud-Est de la France \u00bb<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n<p>Ce travail a \u00e9t\u00e9 men\u00e9 au sein de l\u2019<strong>UMR MIVEGEC<\/strong> (Maladies Infectieuses et Vecteurs : \u00c9cologie, G\u00e9n\u00e9tique, \u00c9volution et Contr\u00f4le) et pr\u00e9par\u00e9 dans le cadre de l\u2019<strong>\u00c9cole Doctorale CBS2<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n<p>Dirig\u00e9e par <strong>\u00c9ric Leroy<\/strong> (IRD) et co-dirig\u00e9e par <strong>Fr\u00e9d\u00e9ric Thomas<\/strong> (CNRS), cette th\u00e8se explore la diversit\u00e9 et la circulation des coronavirus chez les chauves-souris vivant dans les r\u00e9gions de <strong>Camargue et de Provence<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n<p>Les r\u00e9sultats obtenus apportent un \u00e9clairage nouveau sur la pr\u00e9sence et la dynamique de ces virus dans des milieux temp\u00e9r\u00e9s, o\u00f9 interagissent faune sauvage, activit\u00e9s humaines et \u00e9levages.<\/p>\n\n\n\n<p>\u00c0 partir de <strong>785 \u00e9chantillons de guano<\/strong> collect\u00e9s entre 2022 et 2023 gr\u00e2ce \u00e0 des m\u00e9thodes non invasives, les analyses ont r\u00e9v\u00e9l\u00e9 une <strong>pr\u00e9valence \u00e9lev\u00e9e (19,6 %)<\/strong> de coronavirus, avec une forte variation selon les esp\u00e8ces et les sites \u00e9tudi\u00e9s.<\/p>\n\n\n\n<p>Les \u00e9tudes phylog\u00e9n\u00e9tiques ont permis d\u2019identifier <strong>plusieurs sous-genres d\u2019Alphacoronavirus<\/strong>, principalement chez les chauves-souris des genres <em>Pipistrellus<\/em> and <em>Myotis<\/em>, sans d\u00e9tection de s\u00e9quences proches de virus humains connus.<\/p>\n\n\n\n<p>Un suivi approfondi men\u00e9 en <strong>Camargue<\/strong> a conduit \u00e0 une d\u00e9couverte in\u00e9dite : la d\u00e9tection d\u2019un <strong>Merbecovirus<\/strong> (genre <em>Betacoronavirus<\/em>, qui inclut le MERS-CoV) chez <em>Pipistrellus pipistrellus<\/em>.<\/p>\n\n\n\n<p>Il s\u2019agit de la <strong>premi\u00e8re d\u00e9tection en France<\/strong> de ce type de virus, dont le g\u00e9nome complet a pu \u00eatre s\u00e9quenc\u00e9 et compar\u00e9 \u00e0 des souches europ\u00e9ennes d\u00e9j\u00e0 connues.<\/p>\n\n\n\n<p><strong>Vers une meilleure pr\u00e9vention des risques zoonotiques<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>Au-del\u00e0 des r\u00e9sultats scientifiques, cette th\u00e8se s\u2019inscrit dans une d\u00e9marche <strong>One Health<\/strong>, int\u00e9grant les interactions entre sant\u00e9 humaine, animale et environnementale.<\/p>\n\n\n\n<p>Une <strong>consultation d\u2019experts<\/strong> men\u00e9e dans le cadre de cette th\u00e8se a mis en \u00e9vidence plusieurs priorit\u00e9s pour renforcer la pr\u00e9vention des \u00e9pid\u00e9mies \u00e0 venir :<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li>d\u00e9velopper une <strong>surveillance int\u00e9gr\u00e9e<\/strong> entre esp\u00e8ces et territoires,<\/li>\n\n\n\n<li><strong>harmoniser les protocoles<\/strong> de collecte et d\u2019analyse,<\/li>\n\n\n\n<li>favoriser le <strong>partage des donn\u00e9es<\/strong> entre acteurs,<\/li>\n\n\n\n<li>garantir des <strong>financements durables<\/strong> pour la recherche et la formation,<\/li>\n\n\n\n<li>clarifier les <strong>responsabilit\u00e9s institutionnelles<\/strong> entre environnement, sant\u00e9, agriculture et collectivit\u00e9s.<\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n<p>Ces propositions, fond\u00e9es sur les observations de terrain en Camargue, dessinent une <strong>feuille de route concr\u00e8te<\/strong> pour consolider la surveillance des zoonoses en France et en Europe.<\/p>\n\n\n\n<p><strong>Composition du jury<\/strong> :<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li><strong>Nathalie Chazal<\/strong>, Professeure des Universit\u00e9s, CNRS (France) \u2013 Pr\u00e9sidente<\/li>\n\n\n\n<li><strong>No\u00ebl Tordo<\/strong>, Professeur, Institut Pasteur (R\u00e9publique de Guin\u00e9e) \u2013 Rapporteur<\/li>\n\n\n\n<li><strong>Michel Gauthier-Clerc<\/strong>, Directeur de recherche, Universit\u00e9 de Gen\u00e8ve (Suisse) \u2013 Rapporteur<\/li>\n\n\n\n<li><strong>Nathalie Charbonnel<\/strong>, Directrice de recherche, INRAE (France) \u2013 Examinatrice<\/li>\n\n\n\n<li><strong>Bernard Davoust<\/strong>, Docteur v\u00e9t\u00e9rinaire, Aix-Marseille Universit\u00e9 (France) \u2013 Examinateur<\/li>\n\n\n\n<li><strong>Audrey Arnal<\/strong>, Charg\u00e9e de recherche, IRD (France) \u2013 Examinatrice<\/li>\n\n\n\n<li><strong>\u00c9ric Leroy<\/strong>, Directeur de recherche, IRD (France) \u2013 Directeur de th\u00e8se (invit\u00e9)<\/li>\n\n\n\n<li><strong>Fr\u00e9d\u00e9ric Thomas<\/strong>, Directeur de recherche, CNRS (France) \u2013 Co-directeur de th\u00e8se (invit\u00e9)<\/li>\n<\/ul>\n<div id=\"dipi-popup-maker-container\"><\/div>    <script type=\"text\/javascript\">\n        var ajaxurl = \"https:\/\/www.zacam.cnrs.fr\/wp-admin\/admin-ajax.php\";\n    <\/script>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>> \u00a0Mardi 2 d\u00e9cembre 2025 \u00e0 14h.Amphith\u00e9\u00e2tre des Plantes \u2013 IRD MontpellierLien Zoom pour assister \u00e0 la soutenance Une recherche au c\u0153ur des enjeux One Health La Zone Atelier sant\u00e9-environnement 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